Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Itga7-201ENSMUST00000099112 4013 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm28775-201ENSMUST00000186918 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm9866-205ENSMUST00000220998 1973 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm39459-201ENSMUST00000215662 1895 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Usp7-208ENSMUST00000161046 4003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Arhgap19-202ENSMUST00000163265 5058 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 B020031H02Rik-201ENSMUST00000209977 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Dnm2-203ENSMUST00000115404 3455 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Osbpl3-203ENSMUST00000114466 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Zcchc12-203ENSMUST00000115257 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Snx31-201ENSMUST00000013755 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms