Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp72F8VQC1 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms