Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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