Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms