Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 St5-202ENSMUST00000079282 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms