Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 1700102F20Rik-201ENSMUST00000203859 670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 AC154766.1-201ENSMUST00000226550 936 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Smok3c-202ENSMUST00000178402 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm3752-202ENSMUST00000167833 450 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm10128-201ENSMUST00000171360 615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm2956-202ENSMUST00000178722 450 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm10340-202ENSMUST00000188235 615 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 BC002189-201ENSMUST00000195674 598 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 AC108416.3-201ENSMUST00000226148 557 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Slc51b-201ENSMUST00000065894 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Stard3nl-205ENSMUST00000197565 1391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprkP35822 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Ighv2-2-201ENSMUST00000103443 352 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Vegfa-204ENSMUST00000113520 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm22481-201ENSMUST00000122562 192 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 4933424L21Rik-201ENSMUST00000142486 1186 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm29272-201ENSMUST00000185476 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21919-201ENSMUST00000185653 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm28446-201ENSMUST00000186508 694 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm28680-201ENSMUST00000186743 480 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21824-201ENSMUST00000186810 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21862-201ENSMUST00000186957 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21796-201ENSMUST00000187116 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21795-201ENSMUST00000187263 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm28814-201ENSMUST00000187334 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21720-201ENSMUST00000187428 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm20827-201ENSMUST00000187928 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21766-201ENSMUST00000187962 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21837-201ENSMUST00000188117 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21829-201ENSMUST00000188787 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21892-201ENSMUST00000189182 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21777-201ENSMUST00000189307 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm28247-201ENSMUST00000189329 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm28350-201ENSMUST00000189453 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21906-201ENSMUST00000189760 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm29411-201ENSMUST00000189889 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21717-201ENSMUST00000189902 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21765-201ENSMUST00000189913 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21895-201ENSMUST00000189997 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21734-201ENSMUST00000190346 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21902-201ENSMUST00000190361 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm29029-201ENSMUST00000190520 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21898-201ENSMUST00000190727 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm29300-201ENSMUST00000190738 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm20793-201ENSMUST00000190779 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm28879-201ENSMUST00000190973 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21752-201ENSMUST00000191023 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm28841-201ENSMUST00000191284 695 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21813-201ENSMUST00000191291 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21878-201ENSMUST00000191365 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21855-201ENSMUST00000191596 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm20833-201ENSMUST00000192708 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21907-201ENSMUST00000192989 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm20928-201ENSMUST00000192992 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm20851-201ENSMUST00000193038 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm37476-201ENSMUST00000193046 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21678-201ENSMUST00000193567 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21768-201ENSMUST00000194103 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm20836-201ENSMUST00000194582 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm21660-201ENSMUST00000195789 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Fam162b-201ENSMUST00000020064 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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