Protein–RNA interactions for Protein: P01670

Ig kappa chain V-III region PC 6684, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01670 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01670 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01670 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01670 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01670 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms