Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Zcchc12-204ENSMUST00000115258 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Cnpy4-202ENSMUST00000110934 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Zfp94-202ENSMUST00000108436 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Mc1r-201ENSMUST00000098324 3638 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Tmem156-201ENSMUST00000043352 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gm6498-201ENSMUST00000181413 1006 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Hemgn-202ENSMUST00000107764 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Fkbp5-202ENSMUST00000114792 3858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Serping1-202ENSMUST00000111641 1665 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gucd1-202ENSMUST00000118936 2843 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Fgf13-202ENSMUST00000119306 2091 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Olfr749-202ENSMUST00000214290 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Sez6l2-203ENSMUST00000106335 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 L3mbtl2-201ENSMUST00000023029 3487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Aftph-209ENSMUST00000177543 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Ttll1-203ENSMUST00000109480 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gm19611-201ENSMUST00000216401 1865 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gm7435-202ENSMUST00000216003 2424 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Ankrd55-201ENSMUST00000022275 2412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Zbtb37-201ENSMUST00000159250 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gm10608-201ENSMUST00000093527 2509 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Retsat-201ENSMUST00000070597 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Rhpn2-202ENSMUST00000085556 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Numb-204ENSMUST00000117217 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Fam110b-202ENSMUST00000108380 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Wdr6-201ENSMUST00000068700 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Lypd5-201ENSMUST00000032683 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gm35288-201ENSMUST00000216565 2731 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Ankmy1-201ENSMUST00000112998 3243 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Slc1a1-201ENSMUST00000025875 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Srpx2-202ENSMUST00000113304 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Smim7-203ENSMUST00000167290 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Brd9-201ENSMUST00000099384 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Lipa-202ENSMUST00000178114 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Col6a1-201ENSMUST00000001147 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 9330104G04Rik-202ENSMUST00000205647 1943 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gm38336-201ENSMUST00000193040 2549 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 AC160405.2-201ENSMUST00000219008 1987 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gbp6-201ENSMUST00000196520 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Smim18J3QNP2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms