Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl32-202ENSMUST00000220621 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Optn-202ENSMUST00000114996 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr92-203ENSMUST00000216341 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 C7-201ENSMUST00000110689 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gimap8-203ENSMUST00000203509 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gtf3c6Q9D8P7 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gtf3c6Q9D8P7 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Eef1d-218ENSMUST00000154584 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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