Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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