Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ciao1Q99KN2 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms