Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Mthfd1-201ENSMUST00000021443 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Baiap3-201ENSMUST00000169109 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Krt78-201ENSMUST00000164932 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Sftpa1-202ENSMUST00000170719 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Pde1c-204ENSMUST00000164752 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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