Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 416.9 ms