Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Zbtb40Q6PCS8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Zbtb40Q6PCS8 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Zbtb40Q6PCS8 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Zbtb40Q6PCS8 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Zbtb40Q6PCS8 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Zbtb40Q6PCS8 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Zbtb40Q6PCS8 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Zbtb40Q6PCS8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Zbtb40Q6PCS8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Zbtb40Q6PCS8 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Zbtb40Q6PCS8 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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