Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Apoc3-201ENSMUST00000034586 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Apex1-201ENSMUST00000049411 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Rpusd4-201ENSMUST00000034543 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Ces1e-203ENSMUST00000176282 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Chrne-202ENSMUST00000102556 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Ube4bos2-201ENSMUST00000154000 317 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 1810059H22Rik-202ENSMUST00000203662 546 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm34105-201ENSMUST00000214812 571 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Apom-201ENSMUST00000025249 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Rpl6-201ENSMUST00000031617 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Ccr8-201ENSMUST00000048777 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 AC160138.2-201ENSMUST00000220255 1531 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Als2cr12-201ENSMUST00000055313 1540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Rad52-212ENSMUST00000162461 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm42527-201ENSMUST00000198173 1480 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm21818-201ENSMUST00000178828 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm37804-201ENSMUST00000192206 547 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm43628-201ENSMUST00000197871 1187 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm44978-201ENSMUST00000206635 317 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm31784-201ENSMUST00000209523 1053 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm7997-201ENSMUST00000210546 980 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Arl15-202ENSMUST00000224068 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Figla-201ENSMUST00000032070 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Tpm1-203ENSMUST00000050905 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm12168-201ENSMUST00000119051 368 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm12738-201ENSMUST00000122349 536 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Cfap100-202ENSMUST00000127508 417 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm13713-201ENSMUST00000139377 703 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm13713-202ENSMUST00000155472 285 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm22009-201ENSMUST00000158792 343 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm45521-201ENSMUST00000211339 676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Cyp2c44-201ENSMUST00000026211 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms