Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Atp7b-201ENSMUST00000006742 6505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm28042-202ENSMUST00000129685 4472 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms