Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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