Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gcom1-204ENSMUST00000166843 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Tbx22-202ENSMUST00000118986 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf217D3YYI7 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf217D3YYI7 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf217D3YYI7 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf217D3YYI7 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf217D3YYI7 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf217D3YYI7 Pcdhga7-202ENSMUST00000193476 3044 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf217D3YYI7 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms