Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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