Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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