Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ttc21aQ8C0S4 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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