Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbtb40Q6PCS8 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms