Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms