Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms