Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrprbP47758 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrprbP47758 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrprbP47758 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrprbP47758 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrprbP47758 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrprbP47758 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrprbP47758 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrprbP47758 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrprbP47758 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrprbP47758 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms