Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 AC160138.2-201ENSMUST00000220255 1531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm13975-201ENSMUST00000119253 782 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm16058-201ENSMUST00000124392 427 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm35298-201ENSMUST00000222719 430 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Apoc3-201ENSMUST00000034586 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 1700018A04Rik-203ENSMUST00000150418 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm26679-201ENSMUST00000181685 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm38132-201ENSMUST00000193358 707 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm19114-201ENSMUST00000193972 1357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm5054-201ENSMUST00000119351 453 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm15798-201ENSMUST00000120082 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm8817-201ENSMUST00000126769 693 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Tnni1-208ENSMUST00000154463 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm16301-201ENSMUST00000161959 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm3617-201ENSMUST00000173076 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20924-201ENSMUST00000177663 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20816-201ENSMUST00000177765 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20909-201ENSMUST00000178234 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20825-202ENSMUST00000178396 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20852-201ENSMUST00000178761 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20867-201ENSMUST00000178900 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm21443-201ENSMUST00000179070 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20747-201ENSMUST00000179137 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm21394-201ENSMUST00000179523 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm21783-201ENSMUST00000179570 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm21812-201ENSMUST00000179590 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm21721-201ENSMUST00000179595 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20809-201ENSMUST00000179663 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm21118-201ENSMUST00000180179 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20806-201ENSMUST00000180324 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20909-202ENSMUST00000181205 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm26639-201ENSMUST00000181426 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20907-201ENSMUST00000185201 693 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20919-201ENSMUST00000185282 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm21785-201ENSMUST00000185440 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm21808-201ENSMUST00000185495 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20898-201ENSMUST00000185598 693 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20800-201ENSMUST00000185634 693 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm20902-201ENSMUST00000185643 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm21268-201ENSMUST00000185646 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5cP41230 Gm21257-201ENSMUST00000185655 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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