Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Cd1d2-201ENSMUST00000041920 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chd1P40201 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Blnk-202ENSMUST00000117695 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chd1P40201 CT572998.1-201ENSMUST00000219636 1557 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm14504-201ENSMUST00000119391 1497 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 C920021L13Rik-202ENSMUST00000142433 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Swi5-202ENSMUST00000113395 712 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm8696-201ENSMUST00000174777 385 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm18513-201ENSMUST00000177313 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 2900076A07Rik-201ENSMUST00000180385 914 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm7516-201ENSMUST00000186198 706 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Rcvrn-201ENSMUST00000021290 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Enpp3-203ENSMUST00000218044 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm20508-201ENSMUST00000172480 487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Chd1P40201 Gm21188-201ENSMUST00000178618 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm28588-201ENSMUST00000191581 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm36569-201ENSMUST00000195082 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Chd1P40201 Apoc1-204ENSMUST00000207978 339 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm45437-202ENSMUST00000211418 694 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm18500-201ENSMUST00000223493 820 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Tmem14a-201ENSMUST00000027064 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Chd1P40201 Retnlg-201ENSMUST00000065666 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mir195a-201ENSMUST00000083477 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Map2k7-204ENSMUST00000110995 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 1110019D14Rik-202ENSMUST00000181225 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mageb2-201ENSMUST00000101397 1143 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm16470-201ENSMUST00000182456 998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 AC133598.3-207ENSMUST00000225918 704 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 1700063H04Rik-201ENSMUST00000043553 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mageb1-201ENSMUST00000072269 1143 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mageb1-202ENSMUST00000099471 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Olfr1491-204ENSMUST00000216366 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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