Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm37350-201ENSMUST00000192782 313 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm7208-202ENSMUST00000212442 1627 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Rbm43-206ENSMUST00000165313 1975 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Prn-202ENSMUST00000136783 3370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 3930402G23Rik-201ENSMUST00000040608 3086 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Lrrfip1-203ENSMUST00000097649 3645 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Rab11fip3-201ENSMUST00000118828 3271 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Tec-202ENSMUST00000073843 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Aoc1-203ENSMUST00000162948 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Atf7-203ENSMUST00000169033 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Mpp2-201ENSMUST00000017458 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Sh3kbp1-204ENSMUST00000112451 3914 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Kctd19-202ENSMUST00000167294 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Trpc4-205ENSMUST00000200048 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Thbs3-201ENSMUST00000029682 3190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm20611-201ENSMUST00000177492 1131 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm45757-201ENSMUST00000211835 1480 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Slc5a4a-201ENSMUST00000020450 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Vmn2r56-201ENSMUST00000163852 2340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Itga9-202ENSMUST00000124360 1935 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gucy2d-203ENSMUST00000206435 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Slc2a9-202ENSMUST00000067872 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Zfp39-201ENSMUST00000102703 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm14705-201ENSMUST00000154109 1824 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm2447-202ENSMUST00000193813 1815 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Dclre1c-203ENSMUST00000102988 2469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms