Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3298E9PW80 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3298E9PW80 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms