Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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PtprsB0V2N1 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
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PtprsB0V2N1 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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PtprsB0V2N1 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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PtprsB0V2N1 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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PtprsB0V2N1 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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PtprsB0V2N1 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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PtprsB0V2N1 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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PtprsB0V2N1 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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PtprsB0V2N1 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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PtprsB0V2N1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
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PtprsB0V2N1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprsB0V2N1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprsB0V2N1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprsB0V2N1 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprsB0V2N1 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprsB0V2N1 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprsB0V2N1 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprsB0V2N1 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprsB0V2N1 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprsB0V2N1 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprsB0V2N1 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprsB0V2N1 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
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