Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Cbx1-203ENSMUST00000093943 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm13874-202ENSMUST00000135348 941 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Tac1-203ENSMUST00000184986 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC123735.1-201ENSMUST00000227358 605 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms