Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chmp2aQ9DB34 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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