Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms