Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms