Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms