Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms