Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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