Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms