Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtskP55097 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtskP55097 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtskP55097 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtskP55097 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtskP55097 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtskP55097 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms