Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Trpc5-201ENSMUST00000040184 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Hoxc13P50207 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Hoxc13P50207 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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