Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Depdc1b-205ENSMUST00000171178 1404 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprmP28828 1700013D24Rik-201ENSMUST00000112537 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm15777-201ENSMUST00000123463 876 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprmP28828 2410141K09Rik-204ENSMUST00000173583 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Il19-204ENSMUST00000187916 720 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprmP28828 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm6880-201ENSMUST00000114125 627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm5054-201ENSMUST00000119351 453 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm15798-201ENSMUST00000120082 408 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Fam187b-202ENSMUST00000128384 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm12746-201ENSMUST00000151369 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm6695-201ENSMUST00000177264 1172 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Tac1-205ENSMUST00000185187 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 D7Ertd128e-201ENSMUST00000189744 928 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 1810059H22Rik-202ENSMUST00000203662 546 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Olfr170-203ENSMUST00000218837 1008 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 AC124686.1-201ENSMUST00000225546 522 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Olfr170-201ENSMUST00000078603 1008 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Asb5-201ENSMUST00000033918 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm12738-201ENSMUST00000122349 536 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Ccl19-203ENSMUST00000140546 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Cdrt4os1-202ENSMUST00000153180 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm36973-201ENSMUST00000193942 259 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm43628-201ENSMUST00000197871 1187 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm38839-201ENSMUST00000203833 633 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Psme1-201ENSMUST00000089619 711 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm43362-201ENSMUST00000198192 2470 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprmP28828 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 1700057H15Rik-202ENSMUST00000143859 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm14487-201ENSMUST00000145413 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm5435-201ENSMUST00000179295 1150 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Ctsw-201ENSMUST00000025844 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms