Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms