Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms