Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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