Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snx10Q9CWT3 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx10Q9CWT3 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms