Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Card11Q8CIS0 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms