Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Hdhd2-201ENSMUST00000026485 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Psat1-201ENSMUST00000025542 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Pibf1-201ENSMUST00000022650 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 AC157476.2-201ENSMUST00000217574 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Mgat4a-202ENSMUST00000143636 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Nolc1-209ENSMUST00000225780 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 AC104200.1-201ENSMUST00000224527 1746 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Alox8-201ENSMUST00000021262 3226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tcp10b-201ENSMUST00000086787 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tbx22-202ENSMUST00000118986 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Prc1-201ENSMUST00000047558 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Olfr1221-202ENSMUST00000143255 2800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Dntt-202ENSMUST00000112200 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Nfam1-202ENSMUST00000100377 2881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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