Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg9bQ6EBV9 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg9bQ6EBV9 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg9bQ6EBV9 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg9bQ6EBV9 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg9bQ6EBV9 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg9bQ6EBV9 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg9bQ6EBV9 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms