Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm5409-201ENSMUST00000160346 698 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 9330179D12Rik-202ENSMUST00000180811 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Hnmt-203ENSMUST00000114498 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms