Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb42P49222 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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